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Conference Agenda

Overview and details of the sessions of this conference. Please select a date or location to show only sessions at that day or location. Please select a single session for detailed view (with abstracts and downloads if available).

Daily Overview

Session

04 - Photonique et Science du Vivant & Imagerie Optique

Time:

Tuesday, 07/July/2026:

2:00pm - 4:00pm

Session Chair: Gilles TESSIER

Session Abstract

Thématiques abordées :

Les techniques d’imagerie du vivant à toutes les échelles et utilisant tous types de mécanismes de contraste : la microscopie en superrésolution, la microscopie linéaire, nonlinéaire et multi-modale, l’holographie numérique, la tomographie par cohérence optique.

L’instrumentation optique, la correction du front d’onde et le développement de sources adaptées.

L’interaction biologique et physique de la lumière avec des molécules, tissus et organismes, y compris la photothérapie et la chirurgie laser.

La caractérisation spectroscopique d’organismes, de plantes et de biomolécules.

Le développement de modèles numériques ou théoriques, y compris pour la propagation de la lumière en milieu turbide.

Les techniques associées comme le marquage fluorescent, la préparation et conservation d’échantillons biologiques.

Les applications en biologie, en diagnostic et thérapie clinique, en agriculture et d’autres domaines.

Presentations

DE LA MICROSCOPIE HOLOGRAPHIQUE NUMERIQUE AU DIAGNOSTIC DU TROUBLE BIPOLAIRE

P. MARQUET¹, C. LARIVÈRE-LOISELLE², C. SOUBEIRAN², P. PARANT², M. HAOUAT², E. RIOUX-PELERIN², F. PAQUET-MERCIER², G. SHEERER³, M. ROY², C. BEN-ADIBA³, E. BÉLANGER², P. JOURDAIN³

¹CHUV/Université de Lausanne Suisse /Laval University /Research Center CERVO, QC, Canada; ²Laval University /Research Center CERVO, QC, Canada; ³Centre des neurosciences psychiatriques, Département de psychiatrie, CHUV, Suisse

Cette conférence retrace vingt ans de développements en microscopie holographique numérique (DHM), des avancées instrumentales à l’interprétation biophysique du signal de phase quantitative. Couplée aux cellules reprogrammées (iPSC) et à l’IA, la DHM révèle un biomarqueur cellulaire prometteur pour confirmer le diagnostic du trouble bipolaire.

WIDE-FIELD IMAGING MUELLER POLARIMETRY: A NEW PERSPECTIVE ON INTRA-OPERATIVE BRAIN TUMOR VISUALIZATION

T. NOVIKOVA¹, S. CHAE¹, T. LUCAS¹, O. RODRIGUEZ-NUNEZ², E. GROS³, T. MARAGKOU³, R. MCKINLEY⁴, P. SCHUCHT²

¹CNRS Ecole polytechnique, IP Paris, France; ²Department of Neurosurgery, Inselspital, Bern University Hospital, Switzerland; ³Institute of Tissue Medicine and Pathology, University of Bern, Switzerland; ⁴SCAN, University Institute of Diagnostic and Interventional Radiology, Inselspital, Bern University Hospital, University of Bern, Switzerland

Real-time brain tumor delineation remains a major challenge in neurosurgery. Our wide-field imaging Mueller polarimeter visualizes brain tumor border by revealing the optical anisotropy of tumor-free white matter, arising from the presence of nerve fiber tracts and disrupted by tumor growth, in the maps of retardance and azimuth of the optical axis

CARACTERISATION DU COUPLAGE NEUROVASCULAIRE DANS LA RETINE HUMAINE A HAUTE RESOLUTION SPATIO-TEMPORELLE

C. BAUDET¹, P. SENEE¹, L. KRAFFT², I. LOUKILI¹, O. THOUVENIN¹, M. PAQUES³, S. MEIMON², P. MECE¹

¹Institut Langevin, ESPCI Paris, CNRS, PSL Université, Paris, France; ²DOTA, ONERA, Universit´e Paris Saclay, F-91123 Palaiseau, France; ³Institut de la Vision, Sorbonne Universit´e, INSERM, CNRS, 17 rue Moreau, F-75012 Paris, France

Nous pr´esentons une m´ethode d’imagerie in vivo du couplage neurovasculaire dans la r´etine
humaine, avec r´esolution submicrom´etrique et temporelle de 10ms. L’AO-RSO permet de
quantifier pr´ecis´ement des dilatations art´erielles localis´ees, ouvrant de nouvelles perspectives
pour l’´etude pr´ecoce des dysfonctionnements r´etiniens.

AUTOMATED OCT-BASED DEEP LEARNING FRAMEWORK FOR CORNEAL LAYER SEGMENTATION AND QUANTITATIVE TRANSPARENCY ASSESSMENT AFTER PRK

N. VIVAS BRAS¹, B. MEMMI², C. SOUBEIRAN^1,3, M. VILBERT¹, M. BOUHASSANE¹, C. GEORGEON², V. BORDERIE², K. PLAMANN^1,4, A. CHESSEL¹

¹Laboratoire d'Optique et Biosciences, École polytechnique, Institut Polytechnique de Paris, France; ²GRC 32, Transplantation et Thérapies Innovantes de la Cornée — Sorbonne Université, Centre Hospitalier National d’Ophtalmologie des Quinze-Vingts, Paris, France; ³Centre de recherche CERVO, Université Laval, Quebec, Canada; ⁴Laboratoire d'Optique Appliquée , CNRS, ENSTA Paris, École Polytechnique, Institut Polytechnique de Paris, Palaiseau, France

We present a fully automated deep learning pipeline for OCT-based corneal analysis, combining layer segmentation, volumetric stromal transparency quantification, and surface haze detection after PRK. The method provides objective, quantitative assessment with high segmentation accuracy (Dice 97.3%, ~3 µm boundary error) and 92% haze detection.

VERS UNE ÉVALUATION OBJECTIVE DE LA QUALITÉ DES GREFFONS CORNÉENS PAR SUIVI DYNAMIQUE DE DIFFUSOMÉTRIE OPTIQUE

A. SARRADE^1,2, L. HOFFART², L. SIOZADE-LAMOINE^1,3, C. PICARD^4,5, T. DAVID¹, J. FADE^1,3

¹Aix Marseille Univ, CNRS, Centrale Med, Institut Fresnel, Marseille, France; ²Ramsay Générale de Santé, Clinique Monticelli-Vélodrome, Marseille, France; ³Centre Européen de Recherche en Imagerie Médicale (CERIMED), Aix-Marseille Univ, CNRS, Marseille, France; ⁴Banque de tissus, Établissement français du sang, Marseille, France; ⁵ADES, Établissement français du sang, Aix-Marseille Univ, CNRS, Marseille, France

À l’aide d’un diffusomètre à bas-flux résolu angulairement observant le signal optique rétrodiffusé par un
greffon de cornée, nous montrons que le suivi temporel du flux rétrodiffusé lors de la diminution de l’œdème semble pouvoir corroborer un critère usuel de caractérisation lié à la fonctionnalité des cellules endothéliales d’un greffon.

IMAGERIE FONCTIONNELLE RÉTINIENNE À RÉSOLUTION CELLULAIRE PAR OCT PLEIN CHAMP TEMPOREL AVEC FAÇONNAGE DE LA FONCTION DE COHÉRENCE TEMPORELLE

O. MARTINACHE¹, M. BERTRAND², I. LOUKILI^1,3, M. ATLAN¹, K. GRIEVE³, P. MECE¹

¹Institut Langevin, ESPCI Paris, CNRS, PSL University, France; ²SharpEye SAS, Gentilly, France; ³Institut de la Vision, Sorbonne Université, INSERM, CNRS, Paris, France

Nous présentons une méthode d’optorétinographie (ORG) à résolution cellulaire basée sur l’OCT plein champ temporel (TD-FFOCT), combinant illumination spatialement incohérente et façonnage spectral. Elle permet une imagerie fonctionnelle en face grand champ, révélant les réponses des cônes et leur variation avec la profondeur et l'excentricité.

L’AGROPHOTONIQUE : MOBILISER L’EXCELLENCE PHOTONIQUE AU SERVICE DES SCIENCES VÉGÉTALES ET AGRONOMIQUES

A. FOURNIER

ARVALIS-institut du végétal, France

La photonique constitue un levier majeur pour outiller les sciences du vivant, du végétal et de l’environnement, en intégrant les contraintes des milieux réels et des usages agronomiques. Nous présentons une synthèse des besoins, du phénotypage à l’envirotypage, et des conditions de transfert pour l'émergance d'instrument pour l'agroécologie.